生活在植物体内的微生物可以促进植物的生长和健康，但它们的基因组和功能多样性在很大程度上仍然难以捉摸。近日，荷兰生态学研究所Jos M. Raaijmakers和荷兰瓦赫宁根大学Marnix H. Medema的研究团队合作，研究发现病原菌诱导的根内菌群抑病功能的激活。宏基因组学和网络推论表明，植物根部的真菌感染在根球区富集了几丁质菊科和黄杆菌科以及几丁质酶基因和各种未知的生物合成基因簇，这些基因簇编码了非核糖体肽合成酶（NRPSs）和聚酮化合物合酶（PKSs）的产生。菌株水平基因组重建后，设计了几丁质和黄杆菌的联合基因簇，以持续抑制真菌根部疾病。定点突变则揭示黄杆菌内一个以前未知的NRPS-PKS基因簇是由内生集团抑制疾病所必须的。该团队的研究结果强调，内生根的微生物群落具有丰富的功能特征，这些特征可以同时保护植物的内部。

Víctor J. Carrión, Juan Perez-Jaramillo, Viviane Cordovez, et al. Pathogen-induced activation of disease-suppressive functions in the endophytic root microbiome. Science, 2019.

DOI: 10.1126/science.aaw9285

https://science.sciencemag.org/content/366/6465/606