解析真核细胞中大量蛋白质的功能仍然具有挑战性。近日，英国爱丁堡大学Juri Rappsilber的研究团队，绘制出人类蛋白质组的共调控图谱，其可用于鉴定蛋白质功能。为了鉴定蛋白质之间的关系，从而对蛋白质进行功能注释，研究人员使用同位素标记质谱法确定了294种生物扰动后10323种人类蛋白质的丰度变化。研究人员应用了机器学习算法treeClust来揭示来自ProteomeHD的共调控人类蛋白质之间的功能关联（ProteomeHD是研究人员的数据和来自Proteomics Identifications数据库的数据集集合）。这产生了人类蛋白质组的共调控图谱。共调节能够捕获没有物理相互作用或共定位的蛋白质之间的关系。例如，过氧化物酶体膜蛋白PEX11β与线粒体呼吸因子的共同调节使研究人员发现了哺乳动物细胞中过氧化物酶体与线粒体之间的细胞器界面。研究人员还预测了用传统方法难以研究的微蛋白的功能。共调节图谱可以在www.proteomeHD.net上浏览。

Georg Kustatscher, Piotr Grabowski, Tina A. Schrader, et al. Co-regulation map of the human proteome enables identification of protein functions. Nature Biotechnology, 2019.

DOI:10.1038/s41587-019-0298-5

https://www.nature.com/articles/s41587-019-0298-5