Nature Biotechnology:蛋白质组共调控图谱可鉴定蛋白质功能
先知报道 先知报道 2019-11-05

组织镶嵌是携带体细胞突变的细胞亚群的存在,与疾病和衰老有关,并且已在多种组织中检测到,包括与肿瘤相邻的正常细胞。近日,美国德克萨斯大学安德森癌症中心Y. A. Jakubek的研究团队,利用大规模分析发现癌症患者非肿瘤样本中存在获得性染色体改变。为了进行大规模组织镶嵌分析,研究人员调查了来自27个癌症位点的1708例正常出现的邻近肿瘤(NAT)组织样本以及来自The Cancer Genome Atlas7149份血液样本中的单倍型特异性体拷贝数变化(sCNA)。研究人员发现sCNA的速率、负担和类型(包括跨越整个染色体臂的sCNA)在整个组织中存在很大差异。研究人员在NAT组织和邻近的肿瘤中记录了匹配的sCNA,这提示了一个共同的克隆起源,以及NAT组织和肿瘤组织都具有相同癌基因的增益的情况,这些癌基因是由不同的亲本单倍体平行产生的。这些结果揭示了区域癌变的特征性泛组织突变,即与癌细胞相邻的致癌过程的存在。

 

Y. A. Jakubek, K. Chang, S. Sivakumar, et al. Large-scale analysis of acquired chromosomal alterations in non-tumor samples from patients with cancer. Nature Biotechnology, 2019.

DOI: 10.1038/s41587-019-0297-6

https://www.nature.com/articles/s41587-019-0297-6


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