非编码遗传变异是表型多样性的主要驱动因素,但功能解释具有挑战性。近日,美国加州大学圣迭戈分校Christopher K. Glass的研究团队,揭示脑细胞类型特异性增强子与启动子相互作用图谱与疾病风险的关系。为了更好地理解与大脑疾病相关的常见遗传变异,研究人员定义了人类大脑主要细胞类型的非编码调节区域。精神疾病主要与神经元中转录增强子和启动子的变异有关,而散发的阿尔茨海默病(AD)变异主要局限于小胶质细胞增强子。连接细胞类型特异性增强子和启动子的疾病风险变异的相互作用组地图揭示了AD中一个扩展的小胶质细胞基因网络。携带AD-risk变异的小胶质细胞特异性增强子的缺失使小胶质细胞中的BIN1表达减少,但在神经元或星形胶质细胞中没有。这些发现修正和扩展了AD中可能受非编码变异影响的基因,并提示了它们可能在其中发挥作用的细胞类型。
Alexi Nott, Inge R. Holtman, Nicole G. Coufal, et al. Brain cell type–specific enhancer-promoter interactome maps and disease risk association. Science, 2019.
DOI: 10.1126/science.aay0793
https://science.sciencemag.org/content/early/2019/11/13/science.aay0793