多药耐药微生物对人类健康构成严重威胁。快速、准确的抗生素敏感性检测(AST)是解决不断升级的抗生素耐药性的关键需求，因为在确定多药耐药生物方面的延误会增加死亡率和广谱抗生素的使用，从而进一步选择耐药生物。然而，目前基于生长的AST检测（如肉汤微量稀释）需要几天才能通知关键的临床决策。快速AST将改变感染患者的护理，同时确保尽可能有效地部署我们的抗生素库。以生长为基础的测定法由于病原体时间加倍而在速度上受到根本的限制，而基因型测定法由于细菌耐药性机制的日益多样化和复杂性而受到限制。近日，美国哈佛大学-麻省理工学院博德研究所Deborah T. Hung的研究团队，开发出能够同时检测基因型和表型的快速、准确抗生素敏感性测定方法。研究人员报道了通过RNA检测GoPhAST-R对基因型和表型AST进行组合的快速测定方法，该方法通过对早期抗生素诱导的转录变化的机器学习分析与同时检测关键遗传抗性决定子的结合来对菌株进行94-99％的准确度分类。这一方法能够提高耐药性检测的准确性，促进分子流行病学的发展，并能够及早发现新兴的耐药性机制。这种双管齐下的方法提供了比标准工作流程快24到36小时的表型AST，并且能够直接从阳性血液培养物中实施的基于杂交的多重RNA检测，从而使得分析时间少于4小时。

Roby P. Bhattacharyya, Nirmalya Bandyopadhyay, Peijun Ma, et al. Simultaneous detection of genotype and phenotype enables rapid and accurate antibiotic susceptibility determination. Nature Medicine, 2019.

DOI: 10.1038/s41591-019-0650-9

https://www.nature.com/articles/s41591-019-0650-9