中国农科院Nature Methods:新的全基因组组装算法
先知报道 先知报道 2019-12-10

现有的长读汇编程序需要数千个中央处理单元的时间来组装人类基因组,并且在吞吐量和成本方面都被测序技术所超越。近日,中国农业科学院农业基因组研究所阮珏博士与美国哈佛大学医学院李恒博士合作,研发出一个名为wtdbg2的算法,可实现对长读片段的快速、准确组装。研究人员开发了长读组装程序wtdbg2https://github.com/ruanjue/wtdbg2),其速度是已发布工具的2-17倍,同时实现了相当的连续性和准确性。这为将来的人口规模的长读组装铺平了道路。

 

                                             

Jue Ruan, Heng Li. Fast and accurate long-read assembly with wtdbg2. Nature Methods, 2019.

DOI: 10.1038/s41592-019-0669-3

https://www.nature.com/articles/s41592-019-0669-3


加载更多
2703

版权声明:

1) 本文仅代表原作者观点,不代表本平台立场,请批判性阅读! 2) 本文内容若存在版权问题,请联系我们及时处理。 3) 除特别说明,本文版权归纳米人工作室所有,翻版必究!
先知报道

关注与生物医学,膜材料,纳米材料的最新研究

发布文章:2257篇 阅读次数:3082704
纳米人
你好测试
copryright 2016 纳米人 闽ICP备16031428号-1

关注公众号