在几乎所有的细胞过程中，蛋白磷酸化都是调节蛋白功能的关键翻译后修饰。虽然在人类细胞中已经发现了数以万计的磷酸化位点，但还缺乏确定每个磷酸化位点功能重要性的方法。近日，英国欧洲分子生物学实验室（EMBL）Pedro Beltrao和David Ochoa的研究小组合作，发现人类磷酸化蛋白质组的功能全观。研究组手动整理了112种富含磷的蛋白质数据集，这些数据是由104种不同的人类细胞类型或组织产生的。他们重新分析了通过质量控制标准的6,801个蛋白质组学实验，创建了一个包含119,809个人类磷酸化位点的参考磷酸化蛋白质组。为了对功能部位进行优先排序，他们使用机器来学习鉴别59个特征蛋白质组学、结构、调控或进化相关性表征，并将它们整合为一个功能性评分。他们的方法确定了跨越不同分子机制、过程和疾病的调节性磷酸化 位点，并揭示了基因组规模的遗传倾向性。实验验证了几种调节性磷酸位点，包括确定SMAR / SNF染色质重塑复合体SMARCC2中磷酸化位点在神经元分化中的作用。
David Ochoa, Andrew F. Jarnuczak, Cristina Viitez, et al. The functional landscape of the human phosphoproteome. Nature Biotechnology, 2019.
DOI: 10.1038/s41587-019-0344-3
https://www.nature.com/articles/s41587-019-0344-3
