大规模并行单细胞RNA测序(scRNA-seq)正在改变我们对复杂组织的看法，并对异质人群的功能状态产生新的见解。独立的scRNA-seq实验可以探测到超过10,000个细胞的转录组，第一批接近和超过100万个细胞的数据集已经被报道。这增加了对数百甚至数千个样本进行筛选的可能性，以便对遗传、信号和药物扰动进行高通量分析。近日，美国加州理工学院Lior Pachter等人，开发了一种利用DNA寡核苷酸标记细胞蛋白技术，实现高度复用单细胞RNA-seq。研究描述了一种用于单细胞RNA测序的广泛样品多路复用方法，其中通过将鉴定DNA寡核苷酸附着到细胞蛋白上来化学标记固定的细胞。对96重扰动实验的分析揭示了无法从批量测定中识别出的细胞群体结构和转录状态的变化，从而建立了一种有效的方法，该方法能够以单细胞RNA测序的深度和分辨率对大型实验或临床样品中的细胞群体进行研究。

Jase Gehring, Jong Hwee Park, Sisi Chen, et al. Highly multiplexed single-cell RNA-seq by DNA oligonucleotide tagging of cellular proteins. Nature Biotechnology, 2019.

DOI: 10.1038/s41587-019-0372-z

https://www.nature.com/articles/s41587-019-0372-z