Cancer Cell:一种综合基因表达谱分析方法确定肺肿瘤内皮细胞的异质性和血管生成的候选物
先知报道 先知报道 2020-01-16

单细胞水平揭示患者之间、物种(人/小鼠)和模型(体内/体外)肺肿瘤内皮细胞表型异质性的数据仍存有不足。近日,比利时Vib-KULeuven癌症生物学中心Peter Carmeliet、深圳华大基因罗永伦、中山大学李旭日等研究人员,利用一种综合的基因表达谱分析方法,确定肺肿瘤内皮细胞的异质性和血管生成的候选物。研究人员对人/小鼠(周)肿瘤肺和培养的人肺肿瘤内皮细胞(TECs)的56771内皮细胞进行了单细胞RNA(scRNA)测序,并检测到17种已知和16种未知的表型,包括TECs可能调控免疫监视。研究人员将典型的尖端TECs分解为已知的迁移尖端和假定的基底膜破裂重塑表型。尖端TEC信号与患者的生存率相关,尖端/破裂TEC对血管内皮生长因子的阻断最为敏感。只有尖端TECs在物种/模型之间是一致的,并且有保守的标记。研究人员通过功能验证了scRNA测序数据与正交多组学和跨人群肿瘤荟萃分析数据的综合分析结果,并揭示了胶原蛋白修饰是候选的血管生成途径。

亮点

1、对人、小鼠和培养的肺肿瘤模型的56,771个内皮细胞(ECs)进行了单细胞RNA测序。

2、TIP ECs可分解为迁移表型和基底膜重塑表型。

3、毛细血管和静脉内皮细胞表达免疫调节基因信号。

4、综合分析确定胶原修饰是一种血管生成途径。

                                             

Jermaine Goveia, Katerina Rohlenova, Federico Taverna, et al. An Integrated Gene Expression Landscape Profiling Approach to Identify Lung Tumor Endothelial Cell Heterogeneity and Angiogenic Candidates. Cancer Cell, 2020.

DOI: 10.1016/j.ccell.2019.12.001

https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(19)30571-9


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