理解致癌突变如何改变调节蛋白网络对于合理化致癌机制和个体化抗癌治疗很重要。近日,英国伦敦玛丽女王大学Pedro R. Cutillas等研究人员,报告了一种化学磷酸化蛋白质组学方法,从而阐明了哺乳动物细胞中激酶信号网络的拓扑结构。研究人员确定了6000多个可用于推断1500多个激酶与激酶相互作用的蛋白质磷酸化位点,并设计了可从这些磷酸化蛋白质组学数据重建激酶网络拓扑的算法。这一方法在原发性急性髓细胞性白血病和乳腺癌肿瘤中的应用量化了激酶表达与活性之间的关系,并能够鉴定迄今与耐药性表型或特定基因突变相关的未知激酶网络拓扑。使用正交方法,研究人员验证了PIK3CA野生型细胞在乳腺癌细胞中采用MAPK依赖性回路,并且TTK激酶在急性髓样白血病中很重要。这一网络回路的磷酸化蛋白质组学特征可以识别与癌细胞表型和基因型相关的激酶拓扑结构。
Maruan Hijazi, Ryan Smith, Vinothini Rajeeve, et al. Reconstructing kinase network topologies from phosphoproteomics data reveals cancer-associated rewiring. Nature Biotechnology, 2020.
DOI: 10.1038/s41587-019-0391-9
https://www.nature.com/articles/s41587-019-0391-9