人们对不同组织EC的异质性仍然了解不完全。有鉴于此，比利时鲁汶大学Peter Carmeliet、丹麦奥胡斯大学Yonglun Luo、中国中山大学Xuri Li等研究人员，合作绘制了小鼠内皮细胞（EC）的单细胞转录组图谱。

本文要点

1）研究人员从小鼠11种组织中构建了32000多个单EC转录组图谱，并鉴定了78个EC亚群，包括健康组织中的Aqp7+肠毛细血管和血管生成EC。

2）来自大脑/睾丸、肝脏/脾脏、小肠/结肠和骨骼肌/心脏的EC成对地表达部分重叠的标记基因。

3）与异质毛细管EC相比，动脉、静脉和淋巴EC在更多的组织中具有更多相同标志物。

4）来自不同血管床（动脉、毛细血管、静脉、淋巴管）的EC表现出跨组织的转录组相似性，但是组织（而非血管）类型导致EC异质性。

5）代谢转录组分析揭示了EC相似的组织分组现象和组织之间以及单个组织内血管床之间的EC的异质代谢基因特征，它们具有组织类型依赖性模式。

EC图谱在公共scRNA-seq数据集中鉴定EC亚型，并提供了一个强大的发现工具和一个有价值的资源。

参考文献：

Joanna Kalucka, et al. Single-Cell Transcriptome Atlas of Murine Endothelial Cells, Cell, 2020.

DOI：10.1016/j.cell.2020.01.015

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30062-3