基因表达程序随着时间、分化和发育以及对刺激的响应而改变。但是，几乎所有用于在单细胞中分析基因表达的技术都不能直接捕获转录动态。有鉴于此，美国华盛顿大学Jay Shendure、Junyue Cao等研究人员，开发了一个能够表征单细胞中基因表达动态的新技术。

本文要点

1）研究人员提出了一种结合单细胞组合索引和信使RNA标记（Sci-fate）的方法，其使用组合细胞索引和新合成mRNA的4-硫尿苷标记，从而在单个细胞中同时分析完整和新的转录组。

2）研究人员使用Sci-fate研究了超过6000个培养的单细胞中的皮质醇反应。根据这些数据，研究人员量化了细胞周期和糖皮质激素受体激活的动态，并探讨了它们的交叉点。

3）研究人员开发了推断和分析细胞状态转换的软件。

Sci-fate将广泛适用于定量表征各种系统中的转录动态。

参考文献：

Junyue Cao, et al. Sci-fate characterizes the dynamics of gene expression in single cells. Nature Biotechnology, 2020.

DOI：10.1038/s41587-020-0480-9

https://www.nature.com/articles/s41587-020-0480-9