生物纳米孔单分子长读DNA测序速度快且通量高，但同核苷酸片段的准确性降低。有鉴于此，比利时鲁塞尔自由大学的Han Remaut等研究人员，开发出新型生物纳米孔技术可高保真解析同核苷酸序列。

本文要点

1）研究人员将CsgG纳米孔与其细胞外相互作用伴侣CsgF的N末端区域结合在一起，来产生一个双束孔，从而提高了均聚物区域的信号和碱基检出准确度。

2）CsgG与全长CsgF的复合物冷冻电镜结构表明，CsgF的N末端残基结合在孔的β-桶内，进而形成了确定的第二道束口。在与35个残基的CsgF约束肽结合的CsgG的复合物中，第二道束口与主要束口之间的间隔约为25Å。

3）研究人员发现这两个束口有助于单链DNA易位期间的电信号调制。使用原型CsgG–CsgF蛋白孔（具有两个束口）进行DNA测序，将长达9个核苷酸均聚物的单次读取准确性提高了25％至70％。

参考文献：

Sander E. Van der Verren, et al. A dual-constriction biological nanopore resolves homonucleotide sequences with high fidelity. Nature Biotechnology, 2020.

DOI：10.1038/s41587-020-0570-8

https://www.nature.com/articles/s41587-020-0570-8