波尔图大学Maria João Ramos等通过QM/MM方法对人类醛氧化酶hAOX1(human aldehyde oxydase)中N-杂环酞嗪氧化为phthalazin-1(2H)-one的反应过程和自由能变化过程进行计算模拟研究。
该反应过程包含以下几步:1. N-杂环酞嗪底物上的N2原子被Lys893进行质子化 2. Mo基辅酶中的羟基对底物进行亲核进攻 3. 底物中的负氢通过结合到Mo辅酶的硫原子上。
该过程中的决速步骤为负氢的转移过程。作者发现Lys893在该酶催化反应过程中扮演了重要角色,不仅实现了将底物停靠在Mo辅酶附近,同时在催化反应中起作用。作者对该反应过程中Mo的价态变化过程进行追踪,并发现催化位点和FAD位点之间通过氢耦合过程进行电子转移。该催化反应过程改善了催化反应动力学过程,并且Mo辅酶上的MoV和脱氢SH配体协同反应,将FAD转化为FADH·。
参考文献
Pedro Ferreira, Nuno M. F. Sousa A. Cerqueira, Pedro Alexandrino Fernandes, Maria João Romão, and Maria João Ramos*
The catalytic mechanism of human aldehyde oxidase, ACS Catal. 2020
DOI:10.1021/acscatal.0c02627
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acscatal.0c02627