使用RT–PCR和其他先进方法检测SARS-CoV-2可以达到很高的准确性。但是,在缺乏足够资源来处理COVID-19大规模检测的国家,其应用受到限制。有鉴于此,智利塔尔卡大学的Leonardo S. Santo等研究人员,利用基质辅助激光解吸/电离质谱(MALDI-MS)实现对鼻腔拭子中SARS-CoV-2的检测。
本文要点
1)研究人员描述了一种使用MALDI-MS和机器学习分析方法来检测鼻拭子中SARS-CoV-2的方法。
2)这种方法使用了发展中国家临床实验室中常见的设备和专业知识。
3)研究人员从总共362个样品中获得了质谱图(通过RT-PCR获得211个SARS-CoV-2阳性和151个阴性)。
4)研究人员测试了两种特征选择方法和六种机器学习方法,从而确定性能最高的分析方法并确定SARS-CoV-2检测的准确性。
5)支持向量机器模型提供了最高的准确性(93.9%),假阳性为7%,假阴性为5%。
该研究结果表明,MALDI-MS和机器学习分析可用于可靠地检测鼻拭子样本中的SARS-CoV-2。
参考文献:
Fabiane M. Nachtigall, et al. Detection of SARS-CoV-2 in nasal swabs using MALDI-MS. Nature Biotechnology, 2020.
DOI:10.1038/s41587-020-0644-7
https://www.nature.com/articles/s41587-020-0644-7