Cell:可检测单细胞中持续的基因表达谱的新测序方式
先知报道 先知报道 2020-08-06

非遗传因素可导致单个细胞的基因表达水平随时间大幅波动。尚不清楚这些波动是否可以持续比超过细胞分裂的时间。当前用于测量单细胞中基因表达的方法主要依赖于单个时间点测量,这使得难以测量基因表达波动或细胞记忆的持续时间。有鉴于此,美国宾夕法尼亚大学的Arjun Raj等研究人员,利用MemorySeq揭示了与不同细胞行为相关的可遗传性单细胞基因表达程序。

 

本文要点

1研究人员将Luria和Delbrück的波动分析与基于群体的RNA测序(MemorySeq)相结合,用于鉴定整个转录组的基因,其波动可持续存在多个分裂。

2MemorySeq揭示了多个基因模块,这些基因模块在原本同质的克隆群体的稀有细胞中一起表达。

3这些罕见的细胞亚群与生物学上不同的行为有关,例如面对抗癌疗法的增殖。

4非遗传多代波动的鉴定可以揭示单细胞中生物记忆的新形式,并暗示细胞状态的非遗传性遗传力可能是定量的。

 

                                             

 

参考文献:

Sydney M. Shaffer, et al. Memory Sequencing Reveals Heritable Single-Cell Gene Expression Programs Associated with Distinct Cellular Behaviors. Cell, 2020.

DOI:10.1016/j.cell.2020.07.003

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30868-0


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