天然线粒体DNA（mtDNA）突变使得能够推断细胞之间的克隆关系。mtDNA可以与细胞状态的测定一起进行分析，但尚未与解决人体组织复杂性所需的大规模并行方法相结合。有鉴于此，美国哈佛大学的Vijay G. Sankaran等研究人员，开发出大规模平行单细胞线粒体DNA基因分型和染色质分析方法

本文要点

1）研究人员介绍了一种基于高通量液滴的线粒体单细胞测定法，用于转座酶可及染色质测序（scATAC-seq），该方法结合了数千个单细胞中的高可信度线粒体DNA（mtDNA）突变以及其伴随的高质量的染色质可及性测序。

2）可以推断出mtDNA的异质性、克隆关系、细胞状态以及单个细胞中可达到的染色质变异。

3）研究人员揭示了病理性mtDNA变异异质性中的单细胞变异，并将其与个体内部染色质变异性和克隆进化联系在一起。

4）研究人员克隆地追踪了成千上万的癌症细胞，将表观基因组变异性与亚克隆进化联系起来，并推断出体外和体内分化造血细胞的细胞动力学。

因此，该方法可以研究体内细胞群体的动力学和克隆特性。

参考文献：

Caleb A. Lareau, et al. Massively parallel single-cell mitochondrial DNA genotyping and chromatin profiling. Nature Biotechnology, 2020.

DOI：10.1038/s41587-020-0645-6

https://www.nature.com/articles/s41587-020-0645-6