染色质的3D组织可调节许多基因组功能。尽管高通量测序的方法丰富了人们对3D基因组结构的了解，但它们只能提供成对染色质基因座的关联信息，而不能提供单个基因座的直接空间位置信息。基于成像的方法可以直接检测单个细胞中染色质基因座的空间位置，且检测效率很高。但是，目前能够在单个细胞中成像的基因组位点数量仍然有限。有鉴于此，哈佛大学的庄小威和Bogdan Bintu等研究人员，开发了一种在基因组规模对染色质的3D组织和转录活性进行成像的技术。
本文要点
1）研究人员证明了通过顺序杂交对数百个基因组位点进行的多重成像，并可以对整个染色体进行高分辨率构象追踪。
2）研究人员报道了一种荧光原位杂交（MERFISH）的技术用于基因组规模的染色质跟踪，并演示了同时成像的1000多个基因组位点和1000多个基因的初生转录本以及具有里程碑意义的核结构。
3）使用这项技术，研究人员可以表征染色质结构域、区室和跨染色体相互作用以及它们与单细胞转录的关系。
这种高通量、多尺度和多模式成像技术具有广泛应用前景，并可在天然结构和功能背景下提供染色质组织的完整图谱。
参考文献：
Jun-Han Su, et al. Genome-Scale Imaging of the 3D Organization and Transcriptional Activity of Chromatin. Cell, 2020.
DOI：10.1016/j.cell.2020.07.032
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30940-5
