在癌症中染色体不稳定包括对染色体数目和结构的动态改变。SCNA产生的多样性结果可能为肿瘤发展提供必要的变异。有鉴于此,英国弗朗西斯·克里克研究所的Charles Swanton等研究人员,研究揭示了肿瘤发展过程中普遍存在的染色体不稳定性和核型顺序。
本文要点
1)研究人员对来自22种肿瘤类型394个肿瘤的1,421个样本进行了多样本定相和体细胞拷贝数改变(SCNA)分析,以揭示连续染色体不稳定性导致的SCNA异质性。
2)在单一亚克隆中,引起相同基因(例如BCL9、MCL1、ARNT(也称为HIF1B)、TERT和MYC)破坏的平行进化发生在37%的肿瘤中。大多数复发性丢失可能发生在全基因组加倍之前,这是在49%的肿瘤中观察到的克隆事件。
3)然而,即使在全基因组加倍的肿瘤中,大量亚克隆会发生人白细胞抗原(HLA)基因座杂合性缺失和染色体8p丢失至单个单倍体拷贝,这表明核型正发生重塑。影响染色体1q21(包括BCL9、MCL1和ARNT)、5p15.33(TERT)、11q13.3(CCND1)、19q12(CCNE1)和8q24.1(MYC)的焦点扩增通常是由亚克隆造成的,但只发生在单个样本中。
4)研究人员对1,024个独立转移性样本进行分析后发现转移性样本中存在13个局灶性SCNA,包括肾透明细胞癌8q24.1染色体(包含MYC)和HER2+乳腺癌的11q13.3染色体(包含CCND1)。
染色体不稳定性可能导致SCNA的连续性选择,SCNA被认为是在整个肿瘤进化过程中发生的并行事件。
参考文献:
Thomas B. K. Watkins, et al. Pervasive chromosomal instability and karyotype order in tumour evolution. Nature, 2020.
DOI:10.1038/s41586-020-2698-6
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2698-6