癌症积累会导致新抗原的突变,这些新抗原会引发免疫反应,因此需要进行进化选择。有鉴于此,英国伦敦大学玛丽皇后学院的Trevor A. Graham和英国癌症研究所的Andrea Sottoriva等研究人员,示了肿瘤生长过程中新抗原的进化动力学。
本文要点
1)研究人员建立了新抗原进化的数学模型来确定负选择如何重塑正在生长癌症内新抗原的克隆性。
2)该模型预测在没有免疫逃逸情况下,肿瘤新抗原要么是克隆产生的要么是低频发生的。超突变的肿瘤只有在免疫逃逸进化后才能建立。
3)随着负选择强度的增加,负选择情况下体细胞突变的位点频谱看起来更加中性,这与经典的中性理论是一致的。
4)通过对879例结肠癌、胃癌和子宫内膜癌患者的外显子组中新抗原频率和免疫逃逸以及RNA测序数据的分析也证实了这些预测。
参考文献:
Eszter Lakatos, et al. Evolutionary dynamics of neoantigens in growing tumors. Nature Genetics, 2020.
DOI:10.1038/s41588-020-0687-1
https://www.nature.com/articles/s41588-020-0687-1