确保高通量实验中结果的再现性对生物医学研究是至关重要的。有鉴于此,美国密歇根大学的Xiaoquan Wen等研究人员,提出量化和控制高通量实验再现性的统计方法。
本文要点
1)研究人员提出了一套计算方法INTRIGUE,以评估和控制高通量设置中的再现性。他们的方法是建立在再现性的一个新的定义,该定义强调实验单位使用符号效应值估计进行评估时的方向一致性。
2)研究人员提出的方法旨在:1、评估多个研究的整体再现性质量;2、评估再现性在个体实验单位的水平。小组证明他们提出的方法通过模拟能够检测未被观察的批次效应。
3)研究人员进一步展示了该方法在全转录组相关研究中的多功能性:除了再现质量控制,方法也适合调查真正的生物学异质性。
4)最后,研究人员讨论了方法在其他重要领域的可再现研究上的潜在拓展(例如,发表偏差和概念上的复制)。
本文开发的INTRIGUE是基于方向一致性标准的统计框架,用于量化和控制高通量实验中的可重复性。
参考文献:
Yi Zhao, et al. Quantify and control reproducibility in high-throughput experiments. Nature Methods, 2020.
DOI:10.1038/s41592-020-00978-4
https://www.nature.com/articles/s41592-020-00978-4