RNA蛋白质相互作用网络管理许多生物过程，但很难全面检测。有鉴于此，美国北卡罗莱纳大学的Kevin M. Weeks等研究人员，提出了核糖核蛋白网络分析突变剖析（RNP-MaP），用于分析活细胞中RNA-蛋白质相互作用网络。

本文要点

1）研究人员设计了RNP-MaP，是一种活细胞化学探测策略，用于映射核苷酸分辨率下多个蛋白质结合到单个核苷酸的合作互动。

2）RNP-MaP使用异双功能交联剂，可将相互作用的蛋白质冻结在RNA上的原位置，然后通过通读反转录和DNA测序将多个结合的蛋白质定位在单个RNA链上。

3）RNP-MaP揭示，核糖核酸酶P和RMRP，作为序列不同但结构相关联的两种非编码RNA，共享RNP网络且该网络中心定义这些RNA的功能位点。

4）RNP-MaP还确定了在老鼠和人类XIST长非编码RNA之间保守的蛋白质相互作用网络，并定义了其结合位点在XIST功能区域共定位并形成网络的蛋白质群落。

本文开发的RNP-MaP实现了发现和有效验证活细胞中长RNA和功能蛋白质相互作用网络。

参考文献：

Chase A. Weidmann, et al. Analysis of RNA–protein networks with RNP-MaP defines functional hubs on RNA. Nature Biotechnology, 2020.

DOI：10.1038/s41587-020-0709-7

https://www.nature.com/articles/s41587-020-0709-7