本文要点
1)研究人员报道了RNA时间戳,一种通过利用RNA编辑来推断RNA序列数据中单个RNA年龄的方法。
2)为了引入时间戳,研究人员用带有多个MS2结合位点的报告基序来标记RNA,该结合位点募集与MS2衣壳蛋白融合的腺苷脱氨酶ADAR2。ADAR2与标记RNA的结合会导致A-to-I编辑随着时间的推移而积累,从而可以小时刻度精度推断出RNA的年龄。
3)通过结合同一启动子驱动下多个带有时间戳RNA的观察,研究人员可以确定启动子何时处于活动状态。研究人员证明该系统可以推断多个过去的转录事件的存在和时间。
4)研究人员根据过去转录活动的时间,将该方法应用于单个细胞的聚类。
本文研究表明,RNA时间戳将允许将时间信息整合到RNA序列工作流程中。
参考文献:
Samuel G. Rodriques, et al. RNA timestamps identify the age of single molecules in RNA sequencing. Nature Biotechnology, 2020.
DOI:10.1038/s41587-020-0704-z
https://www.nature.com/articles/s41587-020-0704-z