肿瘤微环境(TME)中的基质细胞被结直肠癌(CRC)转化到何种程度尚未得到研究。有鉴于此,北京大学的汤富酬和付卫等研究人员,利用单细胞多组学测序,揭示出人类结直肠癌肿瘤基质细胞中普遍的基因组改变。
本文要点
1)为了剖析这些非恶性细胞的变化,研究人员对21例微卫星稳定的CRC和6名无癌的老年患者进行了单细胞多组学测序。
2)测序结果表明,体细胞拷贝数改变(SCNA)在TME和每位个体正常组织中的免疫细胞、成纤维细胞和内皮细胞中普遍存在。
3)肿瘤中SCNA的成纤维细胞比例(11.1%–47.7%)远高于邻近正常组织的比例(1.1%–10.6%),其中第7号染色体的增益显著富集在TME中,并清楚地表明了克隆扩增。
4)五个基因(BGN、RCN3、TAGLN、MYL9和TPM2)被鉴定为成纤维细胞特异性的生物标志物,其预后较差。
本研究提供了CRC中TME基质细胞中普遍基因组改变的证据和功能相关性。
参考文献:
Yuan Zhou, et al. Single-Cell Multiomics Sequencing Reveals Prevalent Genomic Alterations in Tumor Stromal Cells of Human Colorectal Cancer. Cancer Cell, 2020.
DOI:10.1016/j.ccell.2020.09.015
https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(20)30489-X