质膜上的大多数蛋白质不是均匀分布,而是定位于纳米级尺寸的动态域。为了研究它们的功能相关性,需要能够对细胞群体中膜蛋白纳米域的组成和空间组织进行全面分析的方法。于此,瑞典卡罗林斯卡学院Ana I. Teixeira等人描述了一种基于非显微镜的膜蛋白纳米结构域系综分析方法的发展。
本文要点:
1)该方法被称为膜蛋白纳米域的纳米级破译(NanoDeep),是基于使用DNA纳米组件将膜蛋白组织信息转化为DNA测序读数的方法。
2)利用NanoDeep,研究人员对Her2的纳米环境进行了表征,Her2是癌症中至关重要的膜受体。重要的是,能够通过设计NanoDeep分析的蛋白质清单进行调节。NanoDeep有可能为蛋白质纳米环境的组成和空间组织在膜蛋白功能调节中的作用提供新的见解。
参考文献:
Ambrosetti, E., Bernardinelli, G., Hoffecker, I. et al. A DNA-nanoassembly-based approach to map membrane protein nanoenvironments. Nat. Nanotechnol. (2020).
https://doi.org/10.1038/s41565-020-00785-0