Nature Biotechnology:CRISPR RNA介导的整合酶可实现高效、多重细菌基因组操作
先知报道 先知报道 2020-11-25

现有特异性整合细菌中千碱基DNA序列的技术受到效率低下、依赖重组效率、对多种载体需求以及多重挑战的局限。有鉴于此,美国哥伦比亚大学的Samuel H. Sternberg等研究人员,发现CRISPR RNA介导的整合酶可实现高效、多重细菌基因组操作。

 

本文要点

1为了解决现有细菌基因组特异性整合的缺点,研究人员研发了基于先前报道的霍乱弧菌Tn7样转座子的显著改进版本,该转座子使用I-F CRISPR–Cas系统进行可编程的、RNA引导的转座。

2引导RNA辅助靶向(INTEGRATE)系统优化了转座因子的插入效率,在细菌中以约100%的效率实现了高达10 KB碱基高度准确且无标记的DNA整合。

3使用多间隔CRISPR阵列,研究人员通过结合正交整合和重组酶,在三个基因组位点中实现了同时多重插入和高效的多位点缺失。

4研究人员证明了其在生物医学和工业相关细菌中的强大功能,并在复杂细菌群落中实现了针对靶点和物种的整合。

本文研究揭示了INTEGRATE可作为多用途、千碱基规模因组工程改造的多功能性工具。

 

                                             

 

参考文献:

Phuc Leo H. Vo, et al. CRISPR RNA-guided integrases for high-efficiency, multiplexed bacterial genome engineering. Nature Biotechnology, 2020.

DOI:10.1038/s41587-020-00745-y

https://www.nature.com/articles/s41587-020-00745-y


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