液相色谱-质谱（LC-MS）可以对蛋白质组学进行灵敏的肽分析，但需要大量的分析时间，从而降低了通量。有鉴于此，美国威斯康星大学麦迪逊分校的Joshua J. Coon和Jesse G. Meyer等研究人员，开发出新型定量蛋白质组学分析方法。

本文要点

1）研究人员发现气相肽分离而非液相色谱可以实现快速蛋白质组分析。

2）使用直接输注-霰弹枪蛋白质组分析（DI-SPA）和独立于数据的采集质谱仪（DIA-MS），研究人员证明了在质谱（MS）数据收集的几分钟内可以对500多种蛋白质进行靶向定量（每秒约3.5个蛋白质）。

3）研究人员在人类细胞培养物中营养素、基因型和线粒体毒素之间相互作用的复杂多因素蛋白质组学研究中应用了这项技术。仅在约4.4小时的MS数据收集中，研究人员从132个样品中进行了超过45,000次定量蛋白质测量。

本文研究表明，DI-SPA可在不使用液相色谱（LC）的情况下实现快速、无偏依的蛋白质组定量，从而提供了提高通量的方法，这对于需要对数千种蛋白质组进行分析的药物和生物标记物发现研究至关重要。

参考文献：

Jesse G. Meyer, et al. Quantitative shotgun proteome analysis by direct infusion. Nature Methods, 2020.

DOI：10.1038/s41592-020-00999-z

https://www.nature.com/articles/s41592-020-00999-z