研究表明,Cas13a系统在RNA干扰和分子诊断领域具有巨大的潜力。然而,由于缺乏crRNA设计指南,阻碍了Cas13a系统在RNA编辑和单核苷酸多态性鉴定中的实际应用。在此,上海交通大学丁显廷、郅晓等人经研究认为带有发夹间隔的crRNA可以提高CRISPR/Cas13a系统(称为hs-CRISPR)的特异性。
本文要点:
1)Gibbs自由能分析表明,发夹间隔crRNA (hs-crRNA)抑制Cas13a与非靶标RNA的亲和力。
2)为了进一步验证hs‐CRISPR/Cas13a系统的高特异性,建立了一个乙型肝炎病毒DNA分型平台。与普通crRNA相比,hs‐crRNA在不牺牲CRISPR/Cas13a系统的敏感性的前提下,将特异性提高了三倍。
3)此外,通过理论模拟阐明了Cas13a/hs‐crRNA/靶RNA组成的机制,研究结果表明发夹间隔crRNAs与传统的Cas13a系统兼容。
综上所述,此工作建立在对Cas13a激活的基本认知之上,为CRISPR/Cas13a系统crRNA的合理设计提供了重要的改进。
Yuqing Ke, et al. Hairpin‐Spacer crRNA‐Enhanced CRISPR/Cas13a System Promotes the Specificity of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Identification. Adv. Sci., 2021.
DOI: 10.1002/advs.202003611
https://doi.org/10.1002/advs.202003611