Angew:Zn依赖糖苷水解酶机理研究
纳米技术 纳米 2021-02-03

近期人们发现的Zn依赖保留糖苷水解酶(glycoside hydrolases),构建在Zn(Cys)3(Glu)配合物附近,其中的反应机理仍没有很好的理解。尤其是,在目前人们认为的机理中,Zn配位的半胱氨酸亲核试剂,通过硫代糖基酶中间体进行反应,该机理过程是一种具有争议的过程,特别是关于其中中间体C-S键的强度。有鉴于此,约克大学Gideon J. Davies、巴塞罗那大学Carme Rovira等报道了合成β-L-arabinofuranosidase抑制剂,而且考察了其预催化亲核试剂生成不可水解的加合物反应中的共价型中间体物种。

本文要点:

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作者发现该β-L-arabinofuranosidase抑制剂能够选择性的和GH种127和146种代表性半胱氨酸硫醇催化亲核试剂极性反应。将通过X射线晶体学得到的表征结果进行MD、QM/MM计算模拟,从而实现了对硫代糖基酶中间体的损坏机理过程进行理解

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参考文献

Carme Rovira,* and Gideon J. Davies* et al. Cysteine Nucleophiles in Glycosidase Catalysis: Application of a Covalent b-l-Arabinofuranosidase Inhibitor, Angew. Chem. Int. Ed. 2021

DOI: 10.1002/anie.202013920

https://www.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/anie.202013920


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