对于大样本系列和纵向实验，蛋白质组的准确定量仍然具有挑战性。有鉴于此，英国弗朗西斯克里克研究所的Markus Ralser等研究人员，开发出超快速蛋白质组学分析方法-Scanning SWATH。

本文要点

1）研究人员报告了一种独立于数据的采集方法Scanning SWATH，该方法可加速质谱（MS）占空比，结合短梯度和高流量（800 μl/ min^-1）色谱产生定量蛋白质组。

2）利用前驱物隔离窗口的连续移动，将前驱物质量分配给串联质谱（MS / MS）碎片痕迹，与0.5–5-min色谱梯度的传统数据独立采集（DIA）方法相比，“扫描SWATH”将前驱物鉴定提高了约70％。

3）研究人员展示了超快速蛋白质组学在药物作用模式筛选和血浆蛋白质组学中的应用。扫描SWATH蛋白质组捕获了抑真菌唑类和他汀类药物的作用方式。

4）研究人员确定了43个，并识别出11种新COVID-19严重程度的血浆蛋白质组学生物标志物，从而促进了患者分类和生物标志物的发现。

本文研究表明，在促进蛋白质组药物筛选和临床研究的快速蛋白质组实验中，具有实质性的加速作用和增加深度。

参考文献：

Christoph B. Messner, et al. Ultra-fast proteomics with Scanning SWATH. Nature Biotechnology, 2021.

DOI：10.1038/s41587-021-00860-4

https://www.nature.com/articles/s41587-021-00860-4