RNA结合蛋白（RBP）是RNA加工的关键调节因子，这一过程是基因表达和基因功能所需的。然而，在单个细胞中RBP调节的动力学是未知的。有鉴于此，美国加州大学圣地亚哥分校的Gene W. Yeo等研究人员，在单细胞水平揭示RNA结合蛋白和核糖体的RNA靶点。

本文要点

1）为了解决这种理解上的差距，研究人员开发了STAMP（Surveying Targets by APOBEC-Mediated Profiling），可有效检测RBP-RNA的相互作用。

2）STAMP不依赖于紫外线交联或免疫沉淀，当与单细胞捕获结合使用时，可以在单个汇总实验中鉴定多种RBP和细胞类型的RBP特异性和细胞类型特异性RNA蛋白相互作用。

3）将STAMP与长读测序结合能够以亚型特异性的方式产生RBP靶位点。

4）Ribo-STAMP利用小核糖体亚基来测量了单个细胞中转录组范围的核糖体结合。

本文研究表明，STAMP能够以前所未有的细胞分辨率研究RBP-RNA相互作用组和翻译图谱。

参考文献：

Kristopher W. Brannan, et al. Robust single-cell discovery of RNA targets of RNA-binding proteins and ribosomes. Nature Methods, 2021.

DOI：10.1038/s41592-021-01128-0

https://www.nature.com/articles/s41592-021-01128-0