纳米孔RNA测序是一种有前景的方法，可用于区分和鉴定天然RNA中不同的RNA修饰。扩展了纳米孔测序检测N6-甲基腺苷的能力，研究人员发现其他修饰，特别是假尿苷（Ψ）和2'-O-甲基化（Nm），也导致纳米孔中特征性的碱基识别“错误”特征数据。有鉴于此，西班牙巴塞罗那科技学院的Eva Maria Novoa等研究人员，通过纳米孔测序对天然RNA中的假尿苷化动力学进行了定量分析。
本文要点
1）着眼于Ψ修饰位点，研究人员在mRNA、非编码RNA和rRNA（包括酵母线粒体rRNA中的Pus4依赖Ψ修饰）中检测到了已知的以及以前未发现的Ψ位点。
2）为了探索假尿苷化的动力学，研究人员用氧化、冷和热应激处理了酵母细胞，并在小核RNA、小核仁RNA和mRNA中检测到了热敏感的Ψ-修饰位点。
3）研究人员开发了一个软件nanoRMS，该软件可以通过识别电流强度和痕量曲线改变的单分子读数来估计每个位点的修饰化学计量。
本文研究表明，细胞RNA中能够检测到Nm和ΨRNA修饰，并且可以通过对天然RNA进行纳米孔测序来定量其修饰化学计量。
参考文献：
Oguzhan Begik, et al. Quantitative profiling of pseudouridylation dynamics in native RNAs with nanopore sequencing. Nature Biotechnology, 2021.
DOI：10.1038/s41587-021-00915-6
https://www.nature.com/articles/s41587-021-00915-6
