透明细胞肾癌（ccRCC）是一种异质性疾病，其术后病程可变。有鉴于此，美国哥伦比亚大学的Charles G. Drake、约翰霍普金斯大学的Andrea Califano等研究人员，合作发现与复发相关的肾肿瘤巨噬细胞。

本文要点

1）研究人员为了组装全面的ccRCC肿瘤微环境图谱，对来自未经治疗的ccRCC切除肿瘤和邻近肿瘤组织的造血和非造血亚群进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq）。

2）研究人员利用VIPER算法对单细胞蛋白质活性进行定量，并通过与流式细胞术进行比较验证了该方法。

3）该分析确定了关键的TME亚群及其主要调控因子和候选细胞之间的相互作用，从而揭示了临床相关人群，这些人群无法通过基因表达分析检测到。

4）研究人员发现了以TREM2/APOE/C1Q上调为特征的肿瘤特异性巨噬细胞亚群，并通过空间分辨、定量多光谱免疫荧光进行了验证。在大型临床验证队列中，这些标志物在手术后复发的患者的肿瘤中显著丰富。

本文研究确定了TREM2/APOE/C1Q阳性巨噬细胞浸润是ccRCC复发的潜在预后生物标志物，也是候选的治疗靶标。

参考文献：

Aleksandar Obradovic, et al. Single-cell protein activity analysis identifies recurrence-associated renal tumor macrophages. Cell, 2021.

DOI：10.1016/j.cell.2021.04.038

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00573-0