N1-甲基腺嘌呤 (m1A)是一种普遍存在的可逆RNA修饰,在RNA命运和基因表达的调控中起着至关重要的作用。然而,由于缺乏精确操纵特定转录子中m1A位点的工具,阻碍了阐明特定m 1A修饰的转录子与其表型结果之间的联系。有鉴于此,浙江大学医学院的Yang Li等研究人员,利用Cas13d定向去甲基化酶实现可编程RNA N1-甲基腺嘌呤去甲基化。
本文要点
1)研究人员开发了一种基于CRISPER-Cas13d的工具,称为重工程化m1A修饰正确橡皮擦(简称REMOVER),用于特定转录子的靶定m1A去甲基化。
2)无催化活性的RfxCas13d (dCasRx)融合到m1A去甲基化酶ALKBH3上,而dCasRx-ALKBH3 融合蛋白可以介导m1A修饰的RNAs的潜在去甲基化。
3)研究人员进一步发现REMOVER可以特异性地将MALAT1和PRUNE1 RNAs的m1A去甲基化,从而显著提高其稳定性。
本文研究建立了REMOVER作为特异性m1A修饰转录子的靶向RNA去甲基化工具,这使得进一步阐明特异性转录子m1A修饰与其表型结果之间的关系成为可能。
参考文献:
Shanshan Xie, et al. Programmable RNA N1-Methyladenosine Demethylation by a Cas13d-Directed Demethylase. Angewandte Chemie, 2021.
DOI:10.1002/anie.202105253
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202105253