CBE具有纠正人类致病点突变的潜力。然而，它们的全基因组特异性仍然知之甚少。有鉴于此，北京大学的伊成器等研究人员，开发出胞嘧啶碱基编辑器全基因组脱靶效应检测的新工具。

本文要点

1）研究人员报告了用于评估胞嘧啶碱基编辑器（CBE）特异性的Detect-seq。它能够在全基因组水平上灵敏检测CBE诱导的脱靶位点。

2）Detect-seq利用化学标记和生物素下拉来追踪编辑中间体脱氧尿苷，从而揭示CBE的编辑组。

3）除了不依赖于Cas9和典型依赖于Cas9的脱靶位点之外，研究人员还发现了原始间隔区序列之外和目标链（与单向导RNA配对）上的编辑。

4）这种意外的脱靶编辑很普遍，并且可以表现出很高的编辑率，而它们的发生表现出细胞类型依赖性，无法根据sgRNA序列进行预测。

5）研究人员在测试的目标位点附近发现了原始间隔区外和目标链的编辑，这挑战了CBE不会诱导近端脱靶突变的常识。

本文研究的方法能够对CBE编辑组进行无偏倚分析，并为各种新兴基因组编辑工具的特异性评估提供广泛适用的工具。

参考文献：

Zhixin Lei, et al. Detect-seq reveals out-of-protospacer editing and target-strand editing by cytosine base editors. Nature Methods, 2021.

DOI：10.1038/s41592-021-01172-w

https://www.nature.com/articles/s41592-021-01172-w