DNA的相分离参与染色质包装,调控基因转录。活细胞中DNA相分离的可视化和操作面临着巨大的挑战。有鉴于此,中山大学的毛宗万及大连化学物理所研究的李国辉、张跃斌等研究人员,报道了光开关钌络合物在活细胞中诱导和监测DNA相分离。
本文要点
1)研究团队提出了一个Ru(II)复合物(Ru1),具有高的DNA结合亲和力和DNA“光开关”行为,可以在体外和活细胞中诱导和监测DNA相分离。
2)分子动力学模拟表明,两种具有正电荷亲脂三苯基膦取代基和柔性长烷基链的苯基-PPh3配体,在DNA分子间形成多价结合力以诱导DNA相分离中起重要作用。
3)此外,Ru1可以通过调节染色质的可及性来改变基因的表达模式,如将RNA测序和转座酶可及染色质高通量测序相结合。
本文研究工作提出了第一个基于小分子的活细胞中DNA相分离的示踪剂和调节剂,并阐明了它对染色质状态和转录组的影响。
参考文献:
Wen-Jin Wang, et al. Induction and Monitoring of DNA Phase Separation in Living Cells by a Light-Switching Ruthenium Complex. JACS, 2020.
DOI:10.1021/jacs.1c01424
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.1c01424