化学修饰是扩展天然DNA化学多样性和功能性的有力途径。然而,当化学修饰的寡核苷酸用于基于DNA的反应或结构时,预测、理解和控制它们的动力学和热力学变得非常困难。有鉴于此,四川大学的Li Feng等研究人员,开发了一种化学修饰DNA的天然特性的DNA天平。
本文要点
1)研究人员引入了一种合理设计的DNA天平,能够测量化学修饰DNA在其自然环境中的临界热力学和动力学性质。
2)该DNA天平是使用脚趾点交换原理来操作的,在该原理中,一组重量探针是通过调整向前和向后脚趾点的长度来设计的。
3)一旦放在DNA天平上,化学修饰将使用重量探针进行询问,以确定吉布斯自由能和杂交速率常数的变化。使用环偶氮苯(cAB)修饰的DNA作为模型系统,研究人员证明该DNA天平不仅可以测量稳定的化学修饰,而且还可以解决涉及不稳定化学修饰和瞬时异构化反应的更具挑战性的问题。
本文研究表明,该DNA天平将广泛用于测量携带各种化学修饰的DNA的重要热力学和动力学参数,以及探测DNA中的瞬时化学变化。
参考文献:
Guan Alex Wang, et al. DNA Balance for Native Characterization of Chemically Modified DNA. JACS, 2020.
DOI:10.1021/jacs.1c05236
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.1c05236