北大Adv Sci:单分子精度DNA-蛋白相互作用动态过程
纳米技术 纳米 2021-10-11

DNA-蛋白之间的相互作用在遗传信息的存储、表达和调控过程中扮演着非常重要的角色,人们以往的工作中提出了1D/3D促进扩散机制用于理解DNA-蛋白之间搜索结合蛋白的同源序列表现的极快速率,而且通过单分子实验技术对该过程进行深入研究。但是对于直接观测详细的时序蛋白搜索图像仍存在相当大的困难和挑战。

有鉴于此,北京大学郭雪峰、苏晓东等报道首次实现了基于高增益效应Si纳米线构建场效应晶体管(SiNW FET)进行免于标记的情况中测试DBP-DNA的相互作用(DBP:DNA-binding protein),这种表征过程中成功使用单分子技术。

 本文要点:

(1)

作者对WRKY域和DNA的结合情况实现了可视化表征和较高的灵敏度和单个基团分辨率,令人兴奋的是发现氢键在氨基酸基团与DNA的碱基之间摇摆导致DBP-DNA发生动态集体运动。

(2)

这种原位的、免标记的监测方法为研究生物分子的动态变化过程提供一种有效的实验技术方法。

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参考文献

Wenzhe Liu, Jie Li, Yongping Xu, Dongbao Yin, Xin Zhu, Huanyan Fu, Xiaodong Su, Xuefeng Guo, Complete Mapping of DNA-Protein Interactions at the Single-Molecule Level, Adv. Sci. 2021, 2101383

DOI: 10.1002/advs.202101383

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.202101383


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