目前删除基因组序列的方法是基于CRISPR-Cas9和sgRNA，但这可能是低效和不精确的，出现的错误包括小的插入缺失以及无意的大片段缺失和更复杂的重排。有鉴于此，美国华盛顿大学的Jay Shendure、Junhong Choi等研究人员，开发出能够进行精确基因组删除的新工具。

本文要点

1）研究人员描述了一种基于prime editing的方法——PRIME-Del，它使用一对prime editing sgRNA（pegRNA）来诱导缺失，这些sgRNA的目标是相反的DNA链，不仅对被缺口的位点进行编程，也对修复的结果进行编程。

2）与CRISPR-Cas9和sgRNA对相比，PRIME-Del在对长达10kb的缺失进行编程时实现了明显的高精确度，编辑效率为1-30%。

3）PRIME-Del还可用于将基因组缺失与短的插入结合起来，使缺失的结点不落在原型间隔序列-相邻模体位点。

4）最后，在不影响精确性的前提下，扩展表达prime editing元件可以大幅提高效率。

本文研究表明，PRIME-Del将广泛用于精确、灵活的基因组缺失编程、表位标记以及潜在的基因组重排编程。

参考文献：

Junhong Choi, et al. Precise genomic deletions using paired prime editing. Nature Biotechnology, 2021.

DOI：10.1038/s41587-021-01025-z

https://www.nature.com/articles/s41587-021-01025-z