表观遗传学的重编程是免疫细胞谱系特化的基础,但独特定义免疫细胞类型的模式和它们建立的机制仍不清楚。有鉴于此,美国国家衰老研究所的Ranjan Sen等研究人员,发现转录因子的不同组合决定人类免疫细胞的表观遗传特性。
本文要点
1)研究人员确定了人类外周血中六种免疫细胞类型的谱系特异性DNA甲基化特征,并确定了它们与其他表观遗传学和转录组模式的关系。
2)在每种细胞类型中,系谱特异性低甲基化的部位与转录因子的不同组合有关。相比之下,系谱特异性低甲基化的部位主要局限于适应性免疫细胞。
3)PU.1的结合位点与不同类型细胞中的谱系特异性低甲基化和高甲基化有关,这表明它以一种依赖性的方式调节DNA甲基化。
4)这些观察表明,先天性和适应性免疫谱系是通过组合和情景依赖性使用关键转录因子的不同表观遗传机制来实现的。
本文研究表明,这种细胞特异性表观遗传学和转录模式是未来研究疾病和衰老中免疫失调的基础。
参考文献:
Roshni Roy, et al. DNA methylation signatures reveal that distinct combinations of transcription factors specify human immune cell epigenetic identity. Immunity, 2021.
DOI:10.1016/j.immuni.2021.10.001
https://www.cell.com/immunity/fulltext/S1074-7613(21)00407-6