Nature Methods:一种面向分子式的代谢组靶向方法
先知报道 先知报道 2021-11-07

全面的代谢组分析对生物医学、环境和生物技术研究至关重要。然而,目前基于MS1和MS2的非靶向代谢组学的采集和数据分析策略导致代谢物的低识别率。有鉴于此,西班牙罗维拉·依维尔基里大学的Oscar Yanes等研究人员,开发出一种面向分子式的代谢组靶向方法。

 

本文要点

1研究人员提出了HERMES,一种以分子式为导向的无峰检测方法,它使用原始LC/MS1信息来优化MS2采集。

2用HERMES研究环境中的水、大肠杆菌和人类血浆提取物,研究人员实现了MS2扫描的生物特异性增加,与最先进的数据依赖采集(DDA)方法相比,导致质谱相似性评分和识别率提高。

3HERMES提高了敏感性、选择性和代谢物的注释。

本文研究表明,HERMES是一个R软件包,并且有一个用户友好的图形界面用于数据分析和可视化。

 

      

 

参考文献:

Roger Giné, et al. HERMES: a molecular-formula-oriented method to target the metabolome. Nature Methods, 2021.

DOI:10.1038/s41592-021-01307-z

https://www.nature.com/articles/s41592-021-01307-z


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