G-quadruplexes(G4s)是一种非标准核酸二级结构,调节多种生物学功能,被认为是癌症治疗的潜在分子靶点。然而,由于缺乏分析方法,单基因G4s的调控机制尚不清楚。有鉴于此,清华大学的李景虹等研究人员,通过模块组装多功能探针分析(MAMPA)实现单基因RNA G4s和G4s被占比的单细胞可视化。
本文要点
1)研究人员开发了一种模块组装多功能探针分析方法(MAMPA),用于可视化单个细胞中单个基因的内源性G4s。
2)两个模块化探针分别识别G4结构和相邻的RNA序列,模块组件能够以高特异性对单个RNA中的G4s进行成像。
3)通过对几个基因中的G4s进行成像,研究人员发现G4s在每个细胞系的不同mRNA中稳定地被G4结合蛋白(G4BPs)占据,并定义了“G4被占比率”。
本文研究证明MAMPA适用于大多数实验情况,并发现G4占位比率有可能成为活细胞G4s研究的一个新参数。
参考文献:
Yicong Dai, et al. Single-cell Visualization of Monogenic RNA G-quadruplex and Occupied G-quadruplex Ratio through Module Assembled Multifunctional Probes Assay (MAMPA). Angewandte Chemie, 2021.
DOI:10.1002/anie.202111132
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202111132