Cell:在泛癌普查中发现主导的肿瘤免疫原型
先知报道 先知报道 2022-01-02

癌症在起源组织、驱动突变和周围组织的其他特征方面显示出明显的异质性。各个肿瘤很可能参与了免疫系统的共同模式——即"原型"(archetype),这会创造原型非破坏性的肿瘤免疫微环境(TME),并调节肿瘤的靶向性。有鉴于此,美国加州大学旧金山分校的Matthew F. Krummel、Alexis J. Combes等研究人员,在泛癌普查中发现主导的肿瘤免疫原型。

 

本文要点

1研究人员为了发现主导的免疫系统原型,加州大学旧金山分校(UCSF)的Immunoprofiler Initiative(IPI)使用标准化的方案处理了12种癌症类型的364个个体肿瘤。

2对从细胞亚区获得的流式细胞仪和转录组数据进行计算聚类,发现了各种癌症免疫组成的主导模式。

3这些原型是深刻的,因为研究人员还根据独特的免疫和肿瘤基因表达模式来区分肿瘤,还划分了既定的肿瘤生物学分类。

本文研究表明,IPI资源为理解癌症免疫提供了一个模板,可作为免疫组织主导模式的集合,并为学习如何调节这些模式来改善治疗提供了一个合理的途径。

 

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参考文献:

Alexis J. Combes,et al. Discovering dominant tumor immune archetypes in a pan-cancer census. Cell, 2021.

DOI:10.1016/j.cell.2021.12.004

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)01426-4


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