肝内胆管癌是第二高发的原发性肝脏恶性肿瘤，早期诊断难，手术切除率低，恶性程度高，易累及周边脏器和远处转移，并对放化疗不敏感，预后极差，术后5年生存率仅20%～30%，同时缺乏有效的靶向和免疫治疗。有鉴于此，复旦大学的樊嘉、Qiang Gao和中国科学院上海药物研究所的Hu Zhou等研究人员，绘制出肝内胆管癌的蛋白基因组图谱。
本文要点
1）研究人员利用262名患者的配对肿瘤和邻近的肝脏组织对肝内胆管癌（iCCA）进行了蛋白基因组学特征分析。
2）综合蛋白基因组学分析优先考虑了基因畸变，并揭示了iCCA发病机制的特征。
3）黄曲霉毒素特征与肿瘤的发生、增殖和免疫抑制有关。与突变相关的信号谱显示，TP53和KRAS共同突变可能通过integrin-FAK-SRC途径促进iCCA的转移。FGFR2融合激活了Rho GTP酶途径，可能是新抗原的潜在来源。
4）蛋白质组分析确定了四个患者亚组（S1-S4），并有亚组特异性生物标志物。这些蛋白质组亚组在预后、基因改变、微环境失调、肿瘤微生物群组成和潜在的治疗方法方面具有明显的特征。
5）SLC16A3和HKDC1被进一步确定为与iCCA细胞的代谢重编程有关的潜在预后生物标志物。
本文研究为研究人员和临床医生提供了宝贵的资源，可用于进一步确定iCCA的分子发病机制和治疗机会。
参考文献：
Liangqing Dong, et al. Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma. Cell Metabolism, 2021.
DOI：10.1016/j.cmet.2021.12.007
https://www.cell.com/cell-metabolism/fulltext/S1550-4131(21)00626-4
