Angew:光学细胞标记以用于空间分辨单细胞RNA测序
柚子 柚子 2022-01-12

单细胞RNA测序(scRNA-seq)已成为一种在单细胞水平上分析不同细胞群基因表达的强大工具。然而, cRNA-seq数据集中往往会缺失细胞在多细胞样本中的位置。为了解决这一问题,北京大学陈兴教授、黄岩谊教授和杨莉教授开发了一种OpTAG(光学细胞标签),并将其作为一种新型化学平台以通过空间分辨的方式将功能标签附着到细胞表面。

 

本文要点:

(1)实验利用OpTAG建立了OpTAG-seq,它能够实现空间分辨的scRNA-seq。此外,实验也将OpTAG-seq应用于研究转移癌细胞中空间定义的转录程序,并确定了一组潜在的、癌细胞转移和侵袭的调控因子的基因。

(2)综上所述,OpTAG-seq能够为利用多细胞生物系统的空间信息来分析细胞异质性提供了一种方便的方法。

Qi Tang. et al. Optical Cell Tagging for Spatially Resolved Single-Cell RNA Sequencing. Angewandte Chemie International Edition. 2022

DOI: 10.1002/anie.202113929

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202113929


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