非达霉素(Fdx)被广泛用于治疗艰难梭菌(Cdiff)感染,但其在人类肠道微生物组中窄谱活性的分子基础仍然未知。Cdiff感染是造成医院内死亡的一个主要原因。抑制RNA聚合酶的Fdx以Cdiff为靶标,对肠道共生动物的影响最小,可减少Cdiff感染的复发。有鉴于此,美国洛克菲勒大学的Elizabeth A. Campbell、威斯康辛大学麦迪逊分校的Robert Landick等研究人员,揭示非达霉素对艰难梭菌的窄谱活性基础。
本文要点
1)研究人员展示了Cdiff RNA聚合酶与Fdx复合物的冷冻电镜结构,并确定了Cdiff RNA聚合酶的一个关键的Fdx结合决定因素,该因素在大多数肠道微生物群(如变形菌和拟杆菌)中都不存在。
2)通过结合结构、生化、遗传和生物信息学分析,研究人员确定Cdiff RNA聚合酶中的一个残基是Fdx窄谱活性的敏感元素。
本文研究结果为一个重要人类病原体的靶向药物设计提供了一个蓝图。
参考文献:
Xinyun Cao, et al. Basis of narrow-spectrum activity of fidaxomicin on Clostridioides difficile. Nature, 2022.
DOI:10.1038/s41586-022-04545-z
https://www.nature.com/articles/s41586-022-04545-z