随着人们对RNA在健康和疾病中的重要性越来越重视，对活细胞RNA的检测也取得了一系列进展。荧光染料可以特异性地照亮选择的RNA适配体，其也发展成为一种设计RNA成像探针的重要方向。斯特拉斯堡大学Andrey S. Klymchenko和Mayeul Collot设计了一种基于罗丹明的荧光自猝灭二聚体(o-Gemini)，并评估了其在溶液和活细胞中点亮同源适配体o-Coral的能力。

本文要点：

（1）研究发现，从二聚体中去除生物素可以略微改其善荧光反应，而不会使其失去对同源适配体(o-Coral)的亲和力。此外，用羧基罗丹明取代硫代罗丹明可显著提高亲和度和对o-Coral的开启反应，从而提高检测限度。在表达o-Coral-tagged的活细胞中，没有生物素单位的羧罗丹明类似物o-Gemini能够表现出更高的信号，并更快地被内化到细胞中。

（2）硫代罗丹明相比，亲水性较弱的羧基罗丹明可以更容易穿透细胞膜，并且其对o-Coral的亲和力也较高，进而可以改善成像结果。O-Coral RNA适配体与荧光二聚体的混杂使我们能够调整荧光素的化学结构，从而大大提高探针对o-Coral-tagged RNA的荧光响应。

Kyong Tkhe Fam. et al. Rational Design of Self-Quenched Rhodamine Dimers as Fluorogenic Aptamer Probes for Live-Cell RNA Imaging. Analytical Chemistry. 2022

DOI: 10.1021/acs.analchem.1c04556

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.1c04556