Nature:可视化细菌细胞内原子细节的平移动力学
吴宗涵 HuaWu 2022-09-29

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通过信使RNA将遗传信息翻译成蛋白质是由核糖体完成的,核糖体是细胞中的原始大分子机器之一,该翻译过程可分为四个阶段:起始、延伸、终止和循环,对这一细胞生理过程的深入了解对进一步解析细胞奥秘具有重要意义。尽管目前通过通过冷冻电子断层摄影术(cryo-ET)对细胞内翻译的核糖体进行表征,但之前研究中所表征的结构仅限于纳米尺度的分辨率,仍需更高的分辨表征或分析手段来助力深入研究。

最近,来自德国海德堡欧洲分子生物学实验室的Julia Mahamid团队开发了一种新型的cryo -ET图像处理算法,能够将停滞的核糖体分解到基因组减少 肺炎杆菌的残留水平,并利用这些技术对核糖体进行大规模结构分类和空间分析,解释肺炎杆菌中翻译过程的细节。 

文章要点:

1)用cryo -ET和新型图像处理算法,首次获得了所有翻译核糖体的高分辨率细胞内平均图谱;

2) 该研究还模拟了天然细胞内的翻译延伸,展示了抗生素如何重塑细胞翻译,并揭示在翻译延长过程中,核糖体通常以确定的三维排列方式组装形成多聚核糖体;

3)证明了在细胞内原子水平上对分子过程进行可视化的可行性,并发现多聚核糖体中L9的扩展构象可以减轻碰撞,以促进翻译保真度。

参考资料:

Xue, L., Lenz, S., Zimmermann-Kogadeeva, M. et al. Visualizing translation dynamics at atomic detail inside a bacterial cell. Nature (2022).

DOI: 10.1101/2021.12.18.473270

https://doi.org/10.1038/s41586-022-05255-2

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