蛋白质-RNA相互作用调节RNA的命运和功能，缺陷可导致各种疾病。这种相互作用主要通过基于核苷的紫外光交联方法进行研究，这种方法缺乏广泛的体内相容性和拆解特定氨基酸的能力。

于此，加州大学旧金山分校王磊团队研究团队将潜在的生物活性非天然氨基酸遗传编码到蛋白质中，通过临近触发反应（proximity-enabled reactivity）与结合的RNA反应，并在体内证明了蛋白质与靶RNA（GECX-RNA）的遗传编码化学交联。

将GECX-RNA应用于大肠杆菌中的RNA伴侣Hfq，鉴定出具有氨基酸特异性的靶RNA。将GECX-RNA与哺乳动物细胞中的N6甲基腺苷阅读器蛋白的免疫沉淀和高通量测序相结合，可以在转录组中以单核苷酸分辨率在RNA上识别未知的N6甲状腺苷。

因此，GECX-RNA在核苷酸和氨基酸水平上提供了分辨率，用于询问体内的蛋白质-RNA相互作用。它还使蛋白质和RNA之间共价键的精确工程化成为可能，这将激发RNA相关研究和治疗的创新解决方案。

参考文献：

Sun, W., Wang, N., Liu, H. et al. Genetically encoded chemical crosslinking of RNA in vivo. Nat. Chem. (2022).

https://doi.org/10.1038/s41557-022-01038-4