对microRNAs的亚细胞表达和分布进行多路分析对于理解其时空功能而言至关重要,但这在目前仍然是一个很大的挑战。深圳大学董海峰教授构建了一种基于组合的荧光染料条形码、细胞器靶向元件和一个独立的量化信号编码方法的多路复用细胞器肖像条形码(MOPB),以用于对细胞器中的miRNAs进行高通量分析。
本文要点:
(1)MOPB条形码由负载异色荧光染料、细胞器靶向多肽和分子信标检测探针修饰的核壳介孔二氧化硅纳米颗粒所组成。以线粒体和内质网为模型,实验通过改变Cy3和Cy5的强度来编码4个Cy3/AMCA ER-MOPB和4个Cy5/AMCA Mito-MOPB,以用于区分8种细胞器的miRNAs。
(2)实验结果表明,MOPB策略能够在药物诱导的Ca2+稳态破坏过程中对8种亚细胞水平细胞器miRNAs的改变进行准确分析。综上所述,该研究设计的方法能够对亚细胞miRNAs和多重亚细胞蛋白生物标志物进行监测,以用于药物发现、细胞代谢、信号转导和基因表达调控。
Wei Wei. et al. Multiplexed Organelles Portrait Barcodes for Subcellular MicroRNA Array Detection in Living Cells. ACS Nano. 2022
DOI: 10.1021/acsnano.2c06252
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsnano.2c06252